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  1. 本地clump的数据,自己在 dplyr::tibble列哪些数据才展现哪些数据,比在线的clump的数据要少一些。 然后出现前面:The query to MR-Base exceeded 300 seconds的问题,主要是我把很多exposure的snp放在一个txt文档里面,想一起做clump,后来觉得把exposure 逐个拆开,用for循环来逐个 ...

  2. 请问clump和cluster有什么区别? 如题,我知道作为名词,clump多用于形容一丛植物。 cluster也可以形容一簇一丛,且在韦氏上的解释似乎涵义更丰富,有音节、建筑群、星团、计算机组等…

  3. 总结成一句话就是,我们通过设置p1参数找到与暴露因素具有显著相关的工具变量;然后通过设置clump参数去掉连锁不平衡(LD)的工具变量(简单理解就是彼此工具变量太相关了,研究起来没啥意义);然后我们通过设置r2和kb参数来制定去除LD的标准(默认即可)

  4. 知乎,中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台,于 2011 年 1 月正式上线,以「让人们更好的分享知识、经验和见解,找到自己的解答」为品牌使命。知乎凭借认真、专业、友善的社区氛围、独特的产品机制以及结构化和易获得的优质内容,聚集了中文互联网科技、商业、影视 ...

  5. 做孟德尔随机化时clump后剩了98个snp,然后merge后丢了两个snp,只剩了96个,是结局的GWAS数据有问题吗?

  6. 最近看很多朋友在使用TwoSampleMR提取暴露和结局的时候会出现以下的报错。

  7. www.zhihu.com › topic › 19966710PLINK - 知乎

    之前有个教程,你可以在网上查一下,我的理解是clump是根据r2和p值筛选LD block最有代表性的snp,这样既可以筛掉强相关(r2),也能保留有最强统计证据(p)的snp。kb是设置在计算clump时,只考虑距离我们的snp规定距离的位点。

  8. 知乎,让每一次点击都充满意义 —— 欢迎来到知乎,发现问题背后的世界。

  9. 有没有知道在做孟德尔随机化用TwoSampleMR的时候报错:The query to MR-Base exceeded 300 seconds and t…

  10. 详解mr算法,结果解释,代表论文. 专栏 孟德尔随机化研究 孟德尔随机化研究

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