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15 Ιουν 2021 · 这样能发现很多低相似度的序列，但是比对的速度会慢很多（因为比对的数据量大了6倍）。. 计算量大，耗费时间长。. 比对在正常进行中的，等吧. 时间久也正常，用得人多了可能会慢一点。. 外国网站的话可以下个蓝灯，不用升级VIP，外国人文章中的网站，开 ...
特别是，当你用NCBI的参考序列作为模板和参考序列数据库作为标准来设计引物时，Primer-BLAST可以设计出只扩增某一特定剪接变异体基因的特异引物。 最后建议用oligo6或primer5验证引物自身的特性：发夹结构、引物自身二聚体、错配和引物间二聚体， G的绝对值。
23 Μαΐ 2023 · 第一种可能是你做的物种到现在还没有人做过，属于完全没有测过序列的物种，不过这种可能性是比较低的，因为即使你的物种没有人做过，blast筛选的时候也会有相似的近缘物种序列为你推荐，举个例子，你测了人的序列，假设人的序列不在数据库里面，但 ...
把你设计的引物复制进去之后，点击blast之后会出现一堆，看图形描述或者 分值分析 特异性，引物是否可行. 知乎，中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台，于 2011 年 1 月正式上线，以「让人们更好的分享知识、经验和见解，找到自己的解答 ...
丁香园是面向医生、医疗机构、医药从业者以及生命科学领域人士的专业性社会化网络，提供医学、医疗、药学、生命科学等相关领域的交流平台、专业知识、最新科研进展以及技术服务。
5 Ιαν 2019 · 方法/步骤. 1/8 分步阅读. 首先一定要确保“Exon junction span”选项设置为“primer must span an exon-exon junction”,这是为了排除DNA污染。. 2/8. 产物长度一般设置为90-180为较好。. 3/8. Tm值要在60℃左右，且正反引物的值要接近，不能差太远。. 4/8. GC含量也要接近，不能差 ...
想学生信的医学狗 回复 @遇见哆小啦： 楼主好，我想请教一个问题，我自己提取DNA测序，注释到的基因，想要设计引物看看，用primer-blast验证，出来的结果是这样的，应该是没有找到相应的模板，请问这样的引物序列可以用吗？
知乎 - 有问题，就会有答案
很多刚接触生物学研究的小伙伴经常会问： 应该如何使用ncbi查询目的基因序列、 怎样进行引物的设计、 如何使用blast进行序列比对？ 等等 针对这些问题，小编收集整理了一系列教程，为科研工作者提供一份相对专业和简明的资料，以作基础参考之用！
更新一下，格式问题其实很简单，blast的命令行下有一个参数 outfmt，可以选输出格式。. 参见 ncbi.nlm.nih.gov/books/. 我自己来做这个事的话，有不下十种办法，比对的软件很多，UCSC和ENCODE的 可视化工具 都很不错。. 关键不是学更多的工具，而是搞清楚为何要用这种 ...
